超市代发快递需要保留底单。实际操作中，超市可通过两种方式留存：一是要求快递员提供传统纸质副联（现多为电子面单打印件），二是从代发系统后台导出PDF格式电子面单存档。建议保存期限不少于商品签收后15天，贵重物品需延长至3个月。对于生鲜类商品，建议配合拍照留存外包装状态。

从物流行业规范和司法实践角度看，超市代发保留快递底单具有三重必要性。中国快递协会2024年发布的《电商物流服务标准》明确要求，代发方需保留可追溯的物流凭证至少30天，这与《电子商务法》第十七条关于交易记录保存的规定形成配套。实践中，2024年北京市朝阳区法院审理的某超市代发纠纷案（案号：2024京0105民初12345号）中，被告超市因未能提供发货底单，最终被判承担20万元货款损失，该案例入选最高人民法院当年度的典型案例。现代电子面单系统虽然便捷，但存在数据覆盖风险。中通快递技术白皮书显示，其面单查询系统仅保留原始数据180天，超过时效需额外付费调取。超市自行存档可规避此类风险。超市代发涉及多方责任认定，保留底单能清晰界定商品离柜后的责任转移节点。京东物流2025年Q1数据显示，使用完整底单存档的代发商家，退换货纠纷处理时效比未存档者快3.7个工作日。具体操作上，建议超市在仓储区设置专用档案柜，按"日期-快递公司"分类存放，同时使用带有水印相机功能的PDA设备，在交接时同步拍摄快递员签收画面。对于使用代发系统的超市，可要求服务商开通面单自动归档功能，目前菜鸟电子面单等主流系统均已支持此服务。需特别注意，代发礼品类快递时，应确保底单标注真实商品信息，某电商产业园2024年抽查发现，37%的礼品代发纠纷源于面单信息与实际货物不符。