医药公司药品代发货是可行的，但必须符合相关法律法规要求并确保药品质量安全。药品代发货的合法性取决于药品来源是否正规、受托方是否具备资质、运输条件是否符合标准等因素。若操作规范，委托专业物流企业进行药品代发是安全可靠的。

药品代发货的合规性主要基于以下要点：药品经营企业可以委托具备资质的批发企业储存和运输药品，但需签订协议明确质量责任，并对受托方进行定期审查。药品代发必须确保全程温控符合要求，特别是冷链药品需专业物流支持。例如上海高宝医药物流等企业可提供符合GMP标准的医药冷链运输服务。特殊药品如第二类精神药品的运输需遵守专门条例，但并非限定邮政渠道，顺丰等具备资质的物流企业也可承运。需要注意的是，新开办药品批发企业前5年不得委托第三方物流，而零售连锁企业委托配送时不得直接面向个人消费者发货。网售药品原则上要求发货地址与经营地址一致，但部分地区允许连锁门店委托总部统一发货。为确保安全，委托方需审查受托方的仓储条件、运输能力及质量体系，并通过计算机系统实现数据实时监控。若违反规定代发假劣药品或未经备案操作，则可能构成非法经营罪。因此建议企业在开展代发业务前咨询监管部门或法律人士，建立完整的质量协议和追溯体系。