网店代发货记账本身并不违法，但需要符合相关法律法规要求。关键在于记账行为是否遵循财税规定，以及代发过程中是否存在虚开发票、偷逃税款等违法行为。

从法律层面分析，网店代发货记账的合法性主要取决于三个核心要素：首先是主体资质，根据财政部规定，代理记账业务必须由依法设立的企业承接，个人从事代账属于违法行为；其次是票据真实性，若在代发过程中虚开快递单号或伪造物流信息，可能构成虚开发票罪；最后是税务合规性，通过私人账户收取费用隐瞒收入的行为将被认定为偷税。实践中常见违法情形包括：利用代发物流空包虚构交易、通过拆分订单规避税务监管、为违禁品提供虚假物流凭证等。从监管数据看，2024年全国查处快递领域涉税案件同比增长37%，其中代发货关联案件占比达42%，主要集中于服装、电子配件等类目。建议采用"三单合一"模式（订单、物流单、发票单信息一致），并定期通过电子税务局校验数据真实性。值得注意的是，不同地区监管力度存在差异，例如长三角地区已实现税务与物流数据实时互通，而中西部省份仍以抽查为主。合规的代发货记账应同时满足《电子商务法》第47条关于电子交易数据保存的规定，以及《税收征收管理法》关于账簿管理的具体要求。