亚马逊一件代发海外仓的收费模式主要包含入库费、操作费、仓储费和快递费四大类。入库费根据SKU数量和产品重量分级收取，6个SKU内通常免费；操作费涵盖订单处理、打包贴单等环节，按件计费；仓储费普遍提供30天免租期，超期后按立方厘米或托盘收费；快递费则取决于承运商和目的地，如UPS/USPS标准费率。部分服务商对打包耗材、检测等增值服务另行收费。

该收费结构的合理性源于跨境电商物流的三大核心成本维度：首先是仓内操作成本，包括卸货、分拣、上架等人工密集型环节，这解释了为何入库费和操作费需按件精确计费。海外仓的区位租金差异显著，例如美国洛杉矶仓的月均仓储成本比休斯顿仓高22%，采用动态仓储费能平衡仓库利用率。末端配送成本受地理距离影响，从美西仓发往纽约的快递费比本地配送高35%，因此快递费需与目的地挂钩。行业数据显示，优化后的分级收费模型能使物流总成本降低18%-25%，这也是亚马逊推荐"先分仓再装箱"模式的原因——通过预分配仓点减少二次调拨，从而规避入库配置服务费。当前主流服务商的报价体系中，操作费占比最高（约45%），这与海外仓75%的作业工时集中在订单处理环节的行业特征相符。