物流一件代发是指商家通过找货源、代发货、一件代发等方式，将商品直接从供应商处发货给买家，省去了自己囤货、包装和发货的繁琐过程。而物流一件代发的收费方式主要有以下几种：

1. 代发费用收取方式：

在物流一件代发中，代发费用是商家需要支付的费用之一。代发费用的收取方式一般有两种：一是按照一件代发商品的数量来收取费用，即每发出一件商品就收取一定的费用；二是按照代发商品的总重量或总体积来收取费用，即根据商品的重量或体积大小来确定费用。

2. 物流费用收取方式：

物流费用是指将商品从供应商处发出到买家手中所需支付的运输费用。物流费用的收取方式一般有两种：一是按照商品的重量来收取费用，即根据商品的重量来确定运费；二是按照商品的体积来收取费用，即根据商品的体积大小来确定运费。

3. 保证金收取方式：

在物流一件代发中，为了避免商家恶意操作或出现货款违约等问题，物流公司可能会要求商家支付一定的保证金。保证金的金额一般根据商家的信誉度和交易额来确定，商家在代发过程中如果没有出现问题，则可以全额退还保证金。

4. 其他费用收取方式：

除了代发费用和物流费用之外，还有一些其他费用可能需要商家支付，如包装费、配送费、保险费等。这些费用的收取方式可以根据具体情况而定，一般是根据商品的特殊要求或附加服务来确定。

物流一件代发的收费方式主要包括代发费用、物流费用、保证金和其他费用等几方面。具体的收费方式和金额可以根据商家和物流公司的协商来确定，也可以根据市场行情和竞争情况来调整。商家在选择代发物流服务时，需要综合考虑各个方面的费用，并选择合适的物流合作伙伴，以降低成本、提高效率。